Firefox3.6と4の共存方法についてのエントリ書きましたが、大きな問題が起きてしまいまして…
外部アプリからFirefoxを呼び出す(受け渡しする)と「Firefox は起動していますが応答しません。新しいウィンドウを開くにはまず既存の Firefox プロセスを終了させるか、コンピュータを再起動させなければなりません。」というエラーメッセージが出るようになってしまいました。
Firefoxは同一プロファイルを使う多重起動を許可してないようで、共存するために起動オプションを設定したのが問題だったのでしょうか…かといっていちいち別プロファイルを指定して別ウィンドウ開いていたら意味ないですしね。
とりあえず、Firefox4は今のところアドオンの関係でメインにできないので、一度アンインストールしました。これで問題は解決したというかしてないというか、余裕できたら解決方法を見つけてみます。